红光、远红光和红外光对种子萌发的影响存在显著差异，并且这些影响可以通过光敏色素的转换来解释。

红光的作用：红光通常促进种子的萌发。例如，在莴苣种子的研究中，红光照射可以显著提高萌发率，达到98%。此外，红光通过激活光敏色素（如PhyB），促进种子的早期萌发。然而，红光的效果可能会被随后的远红光所逆转。

远红光的作用：远红光通常抑制种子的萌发。例如，远红光照射会降低莴苣种子的萌发率，甚至低于黑暗对照组。远红光通过激活另一种光敏色素形式（Pfr），抑制种子的萌发。此外，远红光还会增加植物激素ABA的含量，进一步抑制萌发。

红外光的作用：红外光（特别是730纳米波长）通常也抑制种子的萌发。例如，红外光照射会显著降低生菜种子的萌发率。红外光通过影响光敏色素的转换，抑制种子的萌发。

光照顺序的影响：光照顺序对种子萌发有重要影响。如果先照射红光再照射远红光，萌发会被明显抑制；而如果先照射远红光再照射红光，种子又能萌发。这表明光敏色素在不同波长光下可以相互转换，从而调控种子的萌发过程。

实际应用：在农业生产中，利用红光促进需光种子的萌发，而使用远红光抑制不需要光照的种子萌发，可以有效控制种子的萌发时间，从而优化作物的生长周期和产量。

红光、远红光和红外光通过影响光敏色素的转换来调控种子的萌发过程，不同的光照条件可以显著改变种子的萌发率。这种机制在农业生产中有重要的应用价值，可以通过精确控制光照条件来优化作物的生长和产量。