1890年德国细胞学家亨金（H.Henkin，1858—1942）用半翅目的昆虫红蝽（Pyrrhocoridae）做实验，发现减数分裂时精母细胞中含有11对染色体和1条不配对的单条染色体，在减数分裂时，它移向一极，亨金无以为名，就称其为X染色体。后来在其他物种的雄性个体中也发现了X染色体。
    1902年，美国生物学家麦克朗（C.E.McClung，1870——1946）在蝗虫和其他直翅目昆虫中发现了一种与性别相关的特殊染色体，称为副染色体。
    1905年，美国细胞学家威尔逊观察到一种半翅目昆虫（Proteror）雌性的体细胞有12条染色体，而产生的卵细胞中有6条染色体雄性的体细胞中有11条染色体，

    而产生的精子有两种，一种有6条染色体，另一种只有5条染色体。威尔逊将与性别有关的染色体表示为X，缺少它则表示为O。精子的染色体类型就有两种，一种是X型，另一种为O型，而卵细胞均为X型。受精后产生的后代，XO为雄性，XX为雌性。
    同年，美国生物学家史蒂文斯（N.M.Stevens，1861——1912）发现拟步行虫属中黄粉虫（Tenebrio tnolitor）雌雄个体的体细胞染色体数目相同，但雄性的体细胞中有两条染色体大小不同而无法配对，其中一条在雌性的体细胞中也有，但却是成对的。史蒂文斯将雄性独有、无法配对的这条染色体称为Y染色体，并推论性别决定的基础在于是否存在Y染色体。
    1908年，史蒂文斯又发现了果蝇的性染色体为XY 型，即精母细胞中除有一条X染色体之外，还有一条和它同源的Y染色体。史蒂文斯和威尔逊根据异型染色体的存在及其与性别的相关性，分别发现了性染色体，后人众多的实已证实他们的推论是完全正确的。